Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms