Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms