Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMP3P54852 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP3P54852 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP3P54852 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms