Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA4P35212 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms