Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ME2P23368 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ME2P23368 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms