Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms