Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOP08100 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOP08100 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms