Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB1P08034 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB1P08034 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms