Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ZBED1O96006 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ZBED1O96006 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ZBED1O96006 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZBED1O96006 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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