Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF14O43557 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms