Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNPHO15079 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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