Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9YO00507 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms