Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
A4D1N5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
A4D1N5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
A4D1N5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
A4D1N5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms