Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms