Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC8Q9BY41 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms