Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms