Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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