Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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