Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms