Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA6Q92908 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms