Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYRIPQ8NFW9 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYRIPQ8NFW9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms