Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms