Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms