Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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