Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01545Q5VT33 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms