Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBM48Q5RL73 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBM48Q5RL73 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBM48Q5RL73 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBM48Q5RL73 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBM48Q5RL73 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms