Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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