Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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NDUFA9Q16795 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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