Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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