Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms