Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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