Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms