Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL2Q13617 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms