Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms