Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms