Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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