Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACACAQ13085 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACACAQ13085 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms