Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms