Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms