Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ID3Q02535 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ID3Q02535 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ID3Q02535 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ID3Q02535 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ID3Q02535 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ID3Q02535 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms