Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms