Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms