Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRX1P78414 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRX1P78414 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRX1P78414 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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