Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms