Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NAPAP54920 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NAPAP54920 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NAPAP54920 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms