Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLK1P49759 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLK1P49759 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLK1P49759 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.2 ms