Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJC1P36383 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms