Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KB1P23443 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms