Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT1P21579 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms