Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms